语义折叠蛋白质

时间:2019-04-11 21:40:21 阅读:20次

  在科学方面,我们解决了很多问题。仅仅在短短几年前,我们已经绘制了人类基因组图谱。想象一下解锁使我们成为人类的代码。最近,科学家正在研究蛋白质的运作方式。或者更准确地说它们如何折叠。正是在折叠中,我们才了解蛋白质的用途以及它应该做的工作。一旦我们解锁了这个,我们将知道疾病是如何形成,复制的,最重要的是,如何击败它们......所有这些疾病。

  那么语义学的信息科学与蛋白质有什么关系呢?语义也折叠了。那是什么。

  研究折叠蛋白质的科学家发现它是最重要的元素属性。
语义也是如此。将句子简化为最基本的部分,然后得到所谓的三元组 - 即主语,谓词和宾语。请考虑下面的句子;

   “约翰在白宫工作”。

  主题:句子描述的是谁或者是什么?显然,这将是“约翰”。
谓词:描述或将主语与句子的其余部分联系起来的属性是什么?这将是动词“作品”。
对象:该属性的价值是多少?那将是“白宫”。

  所以这个例子很简单。更长的句子怎么样?像这样的东西;

   “约翰,奥巴马总统在芝加哥时代的最爱,
现在是白宫的公共联络人。”

  现在工作更艰难。很明显,约翰仍然是这句话的主题。由于它将约翰与奥巴马总统联系在一起,因此将“最爱”作为谓词进行分配可能很诱人。但是逗号向我们表明,这实际上是对约翰的一种否定描述,而不是句子的中心行为。所以我们留下了“作品”作为谓词。但“工作”连接到什么?是“公众联络”还是“白宫”?更强大的联系是“公众联络”,因为这描述了约翰所做的工作。白宫就是这项工作的所在地,所以它只不过是一个资格赛。

  当我们像孩子一样学习阅读时,我们被教导通过这些例句来推理,就像我刚才描述的那样。当然,你没有深入思考 - 对句子的理解,它的本质是自然的:约翰 - 作品 - 公共联络。其余的只是为这些最重要的事实着色。

  语义学是在没有人为干预的情况下在文本上建立意义的信息科学 - 这包括建立任何句子的三元组。这也就是所谓的语义Web或Web 3.0。从图表的角度来看,这个基本概念有时在概念上表示为这样;

  

  

  你会注意到这个图看起来很像连接在一起的细胞或蛋白质。这是有原因的。就像沿着边缘折叠和匹配的蛋白质一样,为了完成它们的工作,所以做语义三元组。切换到蛋白质示例现在让我们考虑这两个句子;
1。对于每个氧分子,蛋白X为细胞添加两个锌分子。
2。对于每个铁分子,蛋白质Y为细胞添加一分子铜。

  我们的图表现在如下所示;

  

  那发生了什么?每个句子都有自己的三元组。但他们有一个共同的谓词“增加”。因此,我们可以绘制两个主题和两个对象,但具有共同的谓词。

  就像蛋白质折叠并结合起来创造新东西一样,我们在语义科学中也做了同样的事情。因为我们将句子简化为三元组,将它们存储在可以查询的地方,我们可以要求所有与“add(s)”匹配的谓词。

  为什么这很重要?它为科学家,研究人员,商业专业人士,公民提供了从他们的文档,电子邮件或网络中挖掘并收集真实含义的机会。这与Google之类的关键字匹配大不相同。 “add(s)”这个词肯定匹配,但它也是匹配的词语。
但如果句子(1)的作者没有使用“添加”这个词,而是使用“增加”这个词,该怎么办? 。关键字匹配在此处失败。但是语义学也可以理解“添加”和“增加”是相关的,因此查询将导致添加/增加分子的蛋白质的相同科学发现。

  现在让我们将句子(2)从蛋白质Y更改为蛋白质X.对三元组商店进行更严格的查询,您要求主题和谓词匹配,这将产生如下图表。

  

  为什么这很重要?因为现在科学家可以依靠这种搜索指数中内置的智能来传递所有的蛋白质X,它们可以将[某种]分子添加/增加到细胞中。对于科学家来说,有趣的事情是对那些将被添加到细胞中的分子进行分组和分类。

  这是科学界的真正发现。语义学可以让语言脱离困境。它是一种语义学,可以在系统中构建智能系统,因此科学家可以找到,分析并创建新的治疗方法,用于尚未有效治疗的疾病。所以......语义和折叠蛋白确实有很多共同点 - 比你想象的要多。

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